ULK1

ULK1
ساختارهای موجود
PDB	جستجوی هم‌ساخت‌شناسی: PDBe RCSB
فهرست شناسه‌های PDB
	4WNO, 4WNP, 5CI7
معین‌کننده‌ها
نام‌های دیگر	ULK1, ATG1, ATG1A, UNC51, Unc51.1, hATG1, unc-51 like autophagy activating kinase 1
شناسه‌های بیرونی	OMIM: 603168 MGI: 1270126 HomoloGene: 2640 GeneCards: ULK1
موقعیت ژن (موش)
کروموزوم	کروموزوم ۵ (موش)
پایان	110,957,963 bp
الگوی گسترش RNA
	More reference expression data
هستی‌شناسی ژن
عملکرد ملکولی	• transferase activity; • nucleotide binding; • protein kinase activity; • protein serine/threonine kinase activity; • GO:0001948، GO:0016582 پیوند پروتئینی; • ATP binding; • kinase activity; • GTPase binding; • identical protein binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding;
ترکیبات سلولی	• سیتوپلاسم; • سیتوزول; • phagophore assembly site membrane; • extrinsic component of omegasome membrane; • Atg1/ULK1 kinase complex; • extrinsic component of phagophore assembly site membrane; • phagophore assembly site; • autophagosome; • extrinsic component of autophagosome membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • recycling endosome; • guanyl-nucleotide exchange factor complex; • mitochondrial outer membrane; • آسه; • membrane;
فرایند زیستی	• neuron projection regeneration; • GO:0034613 protein localization; • axonogenesis; • فسفرگیری; • GO:0106160 negative regulation of protein-containing complex assembly; • protein phosphorylation; • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation; • cellular response to nutrient levels; • axon extension; • پاسخ به گرسنگی; • protein autophosphorylation; • neuron projection development; • GO:0072468 ورارسانی پیام; • خودخواری; • macroautophagy; • peptidyl-threonine phosphorylation; • regulation of macroautophagy; • positive regulation of autophagosome assembly; • autophagosome assembly; • regulation of autophagy; • positive regulation of autophagy;
	منابع: آمیگو / کوئیک‌گو
هم‌ساخت‌شناسی
	8408
	22241
	ENSG00000177169
	ENSMUSG00000029512
	O75385
	O70405
	XM_011538798، XM_011538799، XR_007063134 NM_003565، XM_011538798، XM_011538799، XR_007063134
	XM_006534852، XM_011249419، XM_011249420، NM_001347394 NM_009469، XM_006534852، XM_011249419، XM_011249420، NM_001347394
	XP_011537100، XP_011537101 NP_003556، XP_011537100، XP_011537101
	NP_033495، XP_006534915، XP_011247721، XP_011247722 NP_001334323، NP_033495، XP_006534915، XP_011247721، XP_011247722
	ویکی‌داده
مشاهده/ویرایش انسان	مشاهده/ویرایش موش

ULK1 یک آنزیم است که در انسان توسط ژن «ULK1» کُدگذاری می‌شود.^[۴]^[۵] دو ایزوفروم این آنزیم یعنی ULK1/2 توسط ژن‌های «ULK1/2» کُدگذاری می‌شود. این آنزیم مهم در خودخواری نقش دارد؛ به ویژه در پاسخ به کاهش اسیدهای آمینه. به‌نظر می‌رسد که ایزوفرم‌های مختلف این آنزیم، تقاوت‌های اندکی با هم داشته باشند.^[۶]

اهمیت بالینی[ویرایش]

با توجه به نقش این آنزیم در خودخواری، بسیاری از بیماری‌ها مانند سرطان،^[۷] اختلالات نورودژنراتیو، اختلالات رشد و تکامل عصبی^[۸] و بیماری کرون^[۹] را می‌توان به بروز اختلال در تنظیم خودخواری نسبت داد. از آنجایی که خودخواری به عنوان یک ویژگی بقای سلولی برای یاخته‌ها عمل می‌کند، تومورها را (زمانی که قبلاً تشکیل شده‌اند) قادر می‌سازد تا از کمبود انرژی و استرس‌های دیگر مانند شیمی‌درمانی را تحمل کنند و زنده بمانند. به همین دلیل، مهار خودخواری ممکن است در درمان سرطان مفید باشد؛ بنابراین، ساخت بازدارنده‌های ULK1 در دست پژوهش و بررسی است.^[۱۰]

تعامل‌های شیمیایی[ویرایش]

این آنزیم به مولکول‌های رَپتور، بکلین ۱، دسته ۳ فسفواینوزیتید ۳-کیناز، GABARAPL2،^[۱۱] GABARAP،^[۱۱]^[۱۲] SYNGAP1^[۱۳] و سینتتین-۱^[۱۳] تعامل پروتئین-پروتئین دارد.

منابع[ویرایش]

↑ ^۱٫۰ ^۱٫۱ ^۱٫۲ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029512 - Ensembl, May 2017
↑ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ Kuroyanagi H, Yan J, Seki N, Yamanouchi Y, Suzuki Y, Takano T, et al. (July 1998). "Human ULK1, a novel serine/threonine kinase related to UNC-51 kinase of Caenorhabditis elegans: cDNA cloning, expression, and chromosomal assignment". Genomics. 51 (1): 76–85. doi:10.1006/geno.1998.5340. PMID 9693035.
↑ "Entrez Gene: ULK1 unc-51-like kinase 1 (C. elegans)".
↑ Ro SH, Jung CH, Hahn WS, Xu X, Kim YM, Yun YS, et al. (December 2013). "Distinct functions of Ulk1 and Ulk2 in the regulation of lipid metabolism in adipocytes". Autophagy. 9 (12): 2103–2114. doi:10.4161/auto.26563. PMC 4028344. PMID 24135897.
↑ Chen MB, Ji XZ, Liu YY, Zeng P, Xu XY, Ma R, et al. (May 2017). "Ulk1 over-expression in human gastric cancer is correlated with patients' T classification and cancer relapse". Oncotarget. 8 (20): 33704–33712. doi:10.18632/oncotarget.16734. PMC 5464904. PMID 28410240.
↑ Lee KM, Hwang SK, Lee JA (September 2013). "Neuronal autophagy and neurodevelopmental disorders". Experimental Neurobiology. 22 (3): 133–142. doi:10.5607/en.2013.22.3.133. PMC 3807000. PMID 24167408.
↑ Henckaerts L, Cleynen I, Brinar M, John JM, Van Steen K, Rutgeerts P, Vermeire S (June 2011). "Genetic variation in the autophagy gene ULK1 and risk of Crohn's disease". Inflammatory Bowel Diseases. 17 (6): 1392–1397. doi:10.1002/ibd.21486. PMID 21560199. S2CID 44342825.
↑ Egan DF, Chun MG, Vamos M, Zou H, Rong J, Miller CJ, et al. (July 2015). "Small Molecule Inhibition of the Autophagy Kinase ULK1 and Identification of ULK1 Substrates". Molecular Cell. 59 (2): 285–297. doi:10.1016/j.molcel.2015.05.031. PMC 4530630. PMID 26118643.
↑ ^۱۱٫۰ ^۱۱٫۱ Okazaki N, Yan J, Yuasa S, Ueno T, Kominami E, Masuho Y, et al. (December 2000). "Interaction of the Unc-51-like kinase and microtubule-associated protein light chain 3 related proteins in the brain: possible role of vesicular transport in axonal elongation". Brain Research. Molecular Brain Research. 85 (1–2): 1–12. doi:10.1016/s0169-328x(00)00218-7. PMID 11146101.
↑ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, et al. (2007). "Large-scale mapping of human protein-protein interactions by mass spectrometry". Molecular Systems Biology. 3 (1): 89. doi:10.1038/msb4100134. PMID 17353931. 89.
↑ ^۱۳٫۰ ^۱۳٫۱ Tomoda T, Kim JH, Zhan C, Hatten ME (March 2004). "Role of Unc51.1 and its binding partners in CNS axon outgrowth". Genes & Development. 18 (5): 541–558. doi:10.1101/gad.1151204. PMID 15014045.

برای مطالعهٔ بیشتر[ویرایش]

Russell RC, Tian Y, Yuan H, Park HW, Chang YY, Kim J, et al. (July 2013). "ULK1 induces autophagy by phosphorylating Beclin-1 and activating VPS34 lipid kinase". Nature Cell Biology. 15 (7): 741–750. doi:10.1038/ncb2757. PMC 3885611. PMID 23685627.
Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A, et al. (October 1998). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XI. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro". DNA Research. 5 (5): 277–286. doi:10.1093/dnares/5.5.277. PMID 9872452.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (November 2000). "DNA cloning using in vitro site-specific recombination". Genome Research. 10 (11): 1788–1795. doi:10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Young AR, Chan EY, Hu XW, Köchl R, Crawshaw SG, High S, et al. (September 2006). "Starvation and ULK1-dependent cycling of mammalian Atg9 between the TGN and endosomes". Journal of Cell Science. 119 (Pt 18): 3888–3900. doi:10.1242/jcs.03172. PMID 16940348.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (November 2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks". Cell. 127 (3): 635–648. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Wissing J, Jänsch L, Nimtz M, Dieterich G, Hornberger R, Kéri G, et al. (March 2007). "Proteomics analysis of protein kinases by target class-selective prefractionation and tandem mass spectrometry". Molecular & Cellular Proteomics. 6 (3): 537–547. doi:10.1074/mcp.T600062-MCP200. PMID 17192257.
Chan EY, Kir S, Tooze SA (August 2007). "siRNA screening of the kinome identifies ULK1 as a multidomain modulator of autophagy". The Journal of Biological Chemistry. 282 (35): 25464–25474. doi:10.1074/jbc.M703663200. PMID 17595159.

این یک مقالهٔ خرد زیست‌شناسی مولکولی است. می‌توانید با گسترش آن به ویکی‌پدیا کمک کنید.

[refGRCm38Ensembl-1] ۱٫۰ ^۱٫۱ ^۱٫۲ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029512 - Ensembl, May 2017

[2] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[3] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid9693035-4] Kuroyanagi H, Yan J, Seki N, Yamanouchi Y, Suzuki Y, Takano T, et al. (July 1998). "Human ULK1, a novel serine/threonine kinase related to UNC-51 kinase of Caenorhabditis elegans: cDNA cloning, expression, and chromosomal assignment". Genomics. 51 (1): 76–85. doi:10.1006/geno.1998.5340. PMID 9693035.

[entrez-5] "Entrez Gene: ULK1 unc-51-like kinase 1 (C. elegans)".

[6] Ro SH, Jung CH, Hahn WS, Xu X, Kim YM, Yun YS, et al. (December 2013). "Distinct functions of Ulk1 and Ulk2 in the regulation of lipid metabolism in adipocytes". Autophagy. 9 (12): 2103–2114. doi:10.4161/auto.26563. PMC 4028344. PMID 24135897.

[Chen_2017-7] Chen MB, Ji XZ, Liu YY, Zeng P, Xu XY, Ma R, et al. (May 2017). "Ulk1 over-expression in human gastric cancer is correlated with patients' T classification and cancer relapse". Oncotarget. 8 (20): 33704–33712. doi:10.18632/oncotarget.16734. PMC 5464904. PMID 28410240.

[Lee_2013-8] Lee KM, Hwang SK, Lee JA (September 2013). "Neuronal autophagy and neurodevelopmental disorders". Experimental Neurobiology. 22 (3): 133–142. doi:10.5607/en.2013.22.3.133. PMC 3807000. PMID 24167408.

[Henckaerts_2011-9] Henckaerts L, Cleynen I, Brinar M, John JM, Van Steen K, Rutgeerts P, Vermeire S (June 2011). "Genetic variation in the autophagy gene ULK1 and risk of Crohn's disease". Inflammatory Bowel Diseases. 17 (6): 1392–1397. doi:10.1002/ibd.21486. PMID 21560199. S2CID 44342825.

[Egan_2015-10] Egan DF, Chun MG, Vamos M, Zou H, Rong J, Miller CJ, et al. (July 2015). "Small Molecule Inhibition of the Autophagy Kinase ULK1 and Identification of ULK1 Substrates". Molecular Cell. 59 (2): 285–297. doi:10.1016/j.molcel.2015.05.031. PMC 4530630. PMID 26118643.

[okazaki-11] ۱۱٫۰ ^۱۱٫۱ Okazaki N, Yan J, Yuasa S, Ueno T, Kominami E, Masuho Y, et al. (December 2000). "Interaction of the Unc-51-like kinase and microtubule-associated protein light chain 3 related proteins in the brain: possible role of vesicular transport in axonal elongation". Brain Research. Molecular Brain Research. 85 (1–2): 1–12. doi:10.1016/s0169-328x(00)00218-7. PMID 11146101.

[12] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, et al. (2007). "Large-scale mapping of human protein-protein interactions by mass spectrometry". Molecular Systems Biology. 3 (1): 89. doi:10.1038/msb4100134. PMID 17353931. 89.

[tomoda-13] ۱۳٫۰ ^۱۳٫۱ Tomoda T, Kim JH, Zhan C, Hatten ME (March 2004). "Role of Unc51.1 and its binding partners in CNS axon outgrowth". Genes & Development. 18 (5): 541–558. doi:10.1101/gad.1151204. PMID 15014045.

[۱]

[۲]

[۳]

[۴]

[۵]

[۶]

[۷]

[۸]

[۹]

[۱۰]

[۱۱]

[۱۲]

[۱۳]